资产评估的科学性与准确性，决定其能够作为认定商业秘密损害赔偿额的有效方式。但在司法审判与知识产权资产评估的结合过程中，明确评估标准、规范评估行为仍是需要探索和完善的内容。
权利人实际损失的计算：实践中权利人主张实际损失，主要依据自身的研发成本、减少的订单数量×平均利润等。直接依据技术秘密研发成本主张实际损失，一般难以得到支持。权利人实际损失，实际上是指权利人预期收益数额，即若无被告的侵权行为，原告本可获得的利润。如原告无证据证明其因被告侵权行为而失去的订单数量，一般可推定侵权行为人新增订单源自权利人因侵权行为失去的订单，权利人可依据侵权行为人订单数量和行业平均利润主张赔偿额。如果证据确凿可信，甚至可依据权利人的利润率确定。但对权利人的举证水平有较高要求，对于销售数量、价格、利润率等均须有比较明确、直接的证据。
侵权人侵权获利的计算：从司法实践看，证明实际损失难度较高，以侵权获利来确定赔偿数额相对容易，因侵权获利证据相对而言较易获得，如：侵权产品销售量×行业平均利润率。鉴于目前我国许多中小企业会计管理制度不完善，权利人要想获取相关的财务数据，困难很大。证明侵权获利还需要证明涉案商业秘密在企业经营获利中贡献率的相应证据。因侵权人的利润有多种来源，一般难以认定侵权人经营所获利润都来源于争议的商业秘密。
这种计算方式面临的问题：一是能否获取完整的侵权人会计管理数据，成为评估侵权人侵权获利的关键；二是侵权人获利来源与争议的商业秘密是否有直接关系。
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